Explicació: per què la variant Delta de Covid-19 s'estén més ràpidament que altres soques

És probable que més persones infectades amb la variant Delta de Covid-19 transmetin la infecció a altres fins i tot abans que sospitin que poden estar malalts.

Un venedor que porta una màscara facial com a precaució contra el coronavirus mostra joguines a la venda a la platja de Fort Kochi a Kochi, Kerala, dilluns 23 d'agost de 2021. (Foto AP: R S Iyer)

A mesura que els científics es troben corrent contra el temps per trobar la base biològica per a la transmissió de la Variant delta de Covid-19, diversos estudis nous han trobat que les mutacions clau reducció de l'eficàcia de les vacunes , i l'elevada infecciositat durant la fase pre-simptomàtica dels pacients es troben entre les principals raons que alimenten la ràpida propagació.

Investigacions epidemiològiques recents suggereixen que la variant Delta (B.1.617.2) és almenys un 40% més transmissible que la variant Alpha identificada per primera vegada al Regne Unit a finals de 2020. A més, amb múltiples estudis mostrant una eficiència reduïda de la vacuna contra la variant Delta, els individus totalment vacunats també continuen sent vulnerables infeccions avançades .

El cap de l'OMS, Tedros Adhanom Ghebreyesus, en una roda de premsa, havia dit anteriorment que Delta és la variant més transmissible identificada fins ara i que s'està convertint ràpidament. la soca dominant de la Covid-19 en molts països. Segons una presentació interna distribuïda als Centres per al Control i la Prevenció de Malalties dels EUA (CDC), la variant Delta és més transmissible que els virus que causen MERS, SARS, Ebola, el refredat comú, la grip estacional i la verola, i és almenys tan contagiosa com la varicel·la.

Font: JHU CSSE i covariants.org

Per què la variant Delta és més infecciosa?

Investigacions recents suggereixen que una mutació clau d'aminoàcids pot estar darrere de la ferotge infectivitat de la variant Delta.

Un equip d'investigadors dirigit pel viròleg Pei-Yong Shi de la branca mèdica de la Universitat de Texas s'ha concentrat en una mutació clau que altera un únic aminoàcid a la proteïna espiga SARS-CoV-2. El canvi s'anomena P681R i transforma un residu de prolina en una arginina, segons un informe sobre l'estudi publicat a la revista Nature. El canvi es produeix al lloc d'escissió de la furina de la proteïna espiga.

Per tal de penetrar a les cèl·lules, les proteïnes hostes han de tallar dues vegades la proteïna espiga SARS-CoV-2. El lloc d'escissió de la furina a Covid-19 és important perquè significa que els enzims hostes, inclosa la furina, poden fer el primer tall. Després d'això, les partícules virals acabades de formar emergeixen d'una cèl·lula infectada que pot infectar les cèl·lules hoste de manera més eficient.

La variant alfa també porta una mutació a la mateixa ubicació, tot i que inclou un canvi en un aminoàcid diferent. L'estudi assegura que en el cas de Delta, la mutació que altera el clivage de la furina ha tingut un efecte profund.

En una preimpressió de l'estudi que es va fer disponible recentment, els investigadors van afirmar que la proteïna de l'espiga es talla de manera molt més eficient a les partícules variant Delta que a l'Alfa, i la mutació P681R és en gran part responsable que l'espiga es retalla de manera eficient.

L'estudi afirma que la mutació P681R és la clau de l'alta infectivitat i la transmissió ràpida de la variant Delta. Els investigadors van trobar que a les cèl·lules epitelials de les vies respiratòries humanes cultivades infectades, les variants Delta s'estenen més ràpidament que Alpha. Però quan els investigadors van eliminar la mutació P681R, es va perdre la diferència en les taxes de transmissió.

L'estudi es fa ressò de les conclusions d'una investigació realitzada per un equip dirigit per Kei Sato, viròleg de la Universitat de Tòquio, que va trobar que les proteïnes de punta que porten el P681R es poden fusionar amb les membranes plasmàtiques de cèl·lules no infectades gairebé tres vegades més ràpid que si la mutació. està perdut.

Font: CoVariants.org i GISAID a través de Our World in Data

Altres mutacions clau també són responsables de la transmissió ràpida de Delta?

Els científics han dit que la variant Delta té diverses mutacions clau i que el canvi P681R, tot i que significatiu, és poc probable que sigui l'únic motiu que impulsi la seva ràpida transmissió.

Els investigadors d'Uganda van dir que el canvi P681R estava present en una variant que es va estendre àmpliament al país a principis del 2021, però que no ha demostrat ser tan infecciosa com Delta. El Variant kappa , el germà de Delta que es va identificar a l'Índia, també va tenir la mateixa mutació, però els investigadors han descobert que la seva proteïna d'espiga es talla amb menys freqüència i es fusiona amb les membranes cel·lulars de manera menys eficient.

Estudis anteriors han trobat que altres mutacions clau en la variant Delta, com ara L452R i D6146, permeten que el virus s'uneixi més fermament a les cèl·lules receptores i escapi de la immunitat amb més facilitat.

De fet, la variant Delta té múltiples mutacions a la subunitat S1 de la proteïna espiga, incloses tres en el domini d'unió al receptor, que milloren la seva capacitat d'unir-se als receptors ACE2 i evadir el sistema immunitari del cos.

Crec que el virus està tenint èxit en volum i velocitat. S'ha convertit en un virus molt més eficient. Passa per persones i per cèl·lules molt més ràpid, va dir a Nature Gary Whittaker, viròleg de la Universitat de Cornell.

Whittaker va dir, a més, que l'estudi ha subratllat la importància de les mutacions al lloc d'escissió de la furina del coronavirus. També va afegir que P681R no serà l'última mutació del lloc d'escissió de furina que caurà preocupació.

Font: CoVariants.org i GISAID a través de Our World in Data

Per què és tan difícil aturar la propagació de la variant Delta?

Un dels altres motius de la ràpida propagació de la variant Delta, tal com es va trobar durant un estudi a Guangzhou, Xina, és el nivell extremadament alt d'infecció en pacients fins i tot en la fase pre-simptomàtica. Això significa que les persones corren el perill de propagar el virus fins i tot abans de sospitar que poden estar infectades.

Un estudi recent de Benjamin Cowling, epidemiòleg de la Universitat de Hong Kong i els seus col·legues, va trobar que les persones van començar a tenir símptomes 5,8 dies després de la infecció per Delta, 1,8 dies després de donar positiu per primera vegada a l'ARN viral. Això, per tant, deixa una finestra perillosa perquè es produeixi la transmissió del virus.

En altres paraules, com que l'aparició dels símptomes es produeix més tard, és probable que més persones infectades amb la variant Delta transmetin la infecció a altres fins i tot abans que sospitin que poden estar malaltes.

L'estudi va trobar que el 74% de les infeccions amb Delta es van produir durant la fase pre-simptomàtica. Els investigadors també van trobar que R-naught, o el nombre bàsic de reproducció, que representa, de mitjana, el nombre de persones que es pot esperar que una sola persona infectada transmeti aquesta malaltia, perquè Delta és de 6,4. Per posar les coses en perspectiva, la R-naught de la soca de Wuhan, segons diversos estudis fets anteriorment, era d'entre 2 i 4.

La reducció de l'eficàcia de la vacuna contra Delta és una qüestió de preocupació?

Diversos estudis han trobat que l'eficàcia de les vacunes es redueix contra la variant Delta, que al seu torn deixa les persones totalment vacunades vulnerables a infeccions innovadores.

wikipedia francine valli

Un estudi anterior de Public Health England havia trobat que l'eficàcia de la vacuna Oxford-AstraZeneca es redueix a 64% contra la variant Delta . Abans, un estudi publicat a la revista The Lancet també havia descobert que les persones totalment vacunades amb la vacuna Pfizer probablement tinguessin més de cinc vegades nivells més baixos d'anticossos neutralitzants contra la variant Delta en comparació amb la soca original.

Més recentment, les dades del Ministeri de Salut d'Israel havien demostrat que hi havia dos trets de Pfizer ofereixen un 64% de protecció contra el Covid, en un moment en què més del 90 per cent dels casos que es van denunciar al país van ser causats per la variant Delta.

Una altra àrea de preocupació és l'eficàcia de les vacunes que minva amb el temps. Investigadors de la Universitat d'Oxford al Regne Unit i de l'Oficina Nacional d'Estadística del país en un estudi recent van trobar que l'efectivitat de la vacuna Pfizer va baixar al 90% al mes després de prendre la segona dosi, al 85% després de dos mesos i 78 per cent després de les tres. Per a AstraZeneca, la protecció equivalent ofert va ser del 67, 65 i 61 per cent.

L'estudi també va trobar que fins i tot en persones totalment vacunades, les infeccions causades per la variant Delta produïen càrregues virals màximes que eren similars a les de les persones no vacunades. Els estudis realitzats als EUA i Singapur han donat resultats similars.

Això vol dir que el punt de preocupació més gran és que fins i tot persones totalment vacunades poden propagar la variant Delta, cosa que dificulta molt trencar la cadena de transmissió.

Un informe publicat pel CDC aquest mes afirma que després de grans concentracions a la ciutat de platja de Provincetown a Massachusetts, es van informar 469 casos de Covid-19 a l'estat, dels quals gairebé tres quartes parts es trobaven entre persones vacunades.

En l'anàlisi es va trobar que, igual que les persones no vacunades, els que han pres les punxades també tenien alt Valors Ct , que indica una elevada càrrega viral. Després de la seqüenciació del genoma de 133 mostres, es va trobar que el 90% dels casos eren causats per la variant Delta. Després de les troballes, el 27 de juliol el CDC va actualitzar les seves directrius una vegada més i va recomanar i fins i tot a les persones vacunades que haurien de portar màscares quan es trobin a zones amb una transmissió substancial i alta de Covid-19.

Comparteix Amb Els Teus Amics: