Explicació: El coronavirus mutat versus proves, vacunes - De Novembre 2022

Noves vacunes i proves contra coronavirus contra Covid-19: la variant de coronavirus que circula al Regne Unit està definida per moltes mutacions. Quins són especialment preocupants? Per què l'OMS ha informat que pot evadir algunes proves de PCR i pot afectar la vacunació?

Una ampolla de la vacuna Pfizer-BioNTech Covid-19 al Guy's Hospital de Londres. Tot i que el virus ha mutat en algunes zones, la majoria de les vacunes es dirigeixen a diverses parts. (Foto AP: Frank Augstein)

A la informació emergent sobre la nova variant del coronavirus SARS-CoV-2 que circula al Regne Unit, una mutació ha estat especialment preocupant. La variant, anomenada VUI 202012/01 i informada com a capaç de transmetre's més ràpidament entre les persones, es defineix per fins a 14 mutacions i tres supressions en el seu material genètic. És especialment preocupant una mutació, N501Y. Tot i que el potencial de la variant per afectar les proves i els resultats de la vacunació encara s'està estudiant, les autoritats sanitàries són molt optimistes que la majoria de proves i vacunes encara funcionaran.



Què és una mutació?

Una mutació significa una alteració del material genètic. En un virus d'ARN com el SARS-CoV-2, les proteïnes estan fetes d'una seqüència d'aminoàcids. Aquest virus conté uns 30.000 'parells de bases', que són com maons col·locats un al costat de l'altre per formar una estructura. Una alteració en aquesta base pot ser una mutació, canviant efectivament la forma i el comportament del virus.

A la variant del Regne Unit, una mutació ha fet que el virus tingui més probabilitats d'unir-se amb proteïnes humanes anomenades receptors. Això s'anomena N501Y.





Què és N501Y?

En paraules senzilles, l'aminoàcid representat per la lletra N, i present a la posició 501 de l'estructura genètica del coronavirus, s'ha substituït en aquesta posició per un altre aminoàcid, representat per Y. La posició on s'ha produït aquesta alteració és a la domini d'unió al receptor de la proteïna espiga. (És la proteïna espiga del virus que s'uneix al receptor humà.)

Per tant, la mutació ha augmentat l'afinitat d'unió del coronavirus. Segons els informes, el virus mutat representa el 60% de les infeccions recents a Londres.



Segons la base de dades de la Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID), la mateixa mutació en el domini d'unió al receptor s'ha informat de manera independent a diversos països, inclosos Sud-àfrica i Austràlia. L'anàlisi de seqüències ha demostrat que aquesta mutació es va originar per separat al Regne Unit i Sud-àfrica.

Què passa amb les altres mutacions del coronavirus?

Les mutacions són comunes, però la majoria d'elles no provoquen cap alteració en l'estructura de les proteïnes que codifiquen; s'anomenen mutacions 'sinònimes', ja que finalment es tradueixen als mateixos aminoàcids. Un altre tipus és la mutació 'no sinònima', que podria provocar un canvi d'aminoàcids.



A la variant que circula al Regne Unit, hi ha sis alteracions sinònimes i catorze mutacions no sinònimes. A més, hi ha tres 'delecions': aminoàcids eliminats de la seqüència.

Segons l'Organització Mundial de la Salut (OMS), a part de N501Y, les mutacions que poden influir en la transmissibilitat del virus en humans són P681H i HV 69/70.



UNIR-SE ARA :L'Express Explained Telegram Channel

I què són P681H i HV 69/70?

P681H : Aquesta mutació s'ha produït a l'aminoàcid present a 681, una altra posició en el domini d'unió al receptor. Aquí l'aminoàcid P ha estat substituït per H. Els Centres per al Control de Malalties (CDC) dels EUA han dit que es tracta d'un lloc amb una gran variabilitat en els coronavirus, i que aquesta mutació específica també ha sorgit espontàniament diverses vegades. L'OMS ha dit que aquesta mutació és d'importància biològica.

Els investigadors han demostrat anteriorment que aquesta mutació pot promoure l'entrada a les cèl·lules epitelials respiratòries i la transmissió en models animals.



Les mostres recents seqüenciades al Centre Africà d'Excel·lència per a la Genòmica de Malalties Infeccioses, la Universitat de Redeemer, Nigèria, han mostrat la seqüència P681H allà. Tanmateix, els investigadors diuen que actualment no tenen proves que indiquin que la variant P681H contribueixi a augmentar la transmissió del virus a Nigèria.

HV 69/70 : Aquesta mutació és el resultat d'una supressió d'aminoàcids a les posicions 69 i 70. Aquestes posicions es troben de nou a la proteïna espiga del virus. Aquesta supressió també s'ha observat a França i Sud-àfrica. El CDC ha dit: Aquesta doble supressió s'ha produït espontàniament moltes vegades i probablement condueixi a un canvi en la forma (és a dir, un canvi conformacional) de la proteïna espiga.



Investigadors en nom de COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK), que va marcar la nova variant al Regne Unit, han dit en el seu informe preliminar que aquesta supressió també es va veure en un brot associat al visó a Dinamarca. En humans, aquesta supressió s'ha associat amb una altra mutació, N439K, que es va produir de nou al domini d'unió al receptor.

L'OMS ha destacat que aquesta supressió pot afectar el rendiment d'algunes proves de RT-PCR que detecten el nou coronavirus.

Com pot afectar les proves de RT-PCR?

L'OMS ha dit que s'ha trobat que la supressió a les posicions 69/70 afecta el rendiment d'alguns assajos de PCR de diagnòstic que utilitzen un 'objectiu del gen S' (a la proteïna 'S' o espiga). Tanmateix, l'OMS també ha dit que la majoria dels assajos de PCR a tot el món utilitzen múltiples objectius i, per tant, no es preveu que l'impacte de la variant en el diagnòstic sigui significatiu.

El CDC també ha dit que la majoria de les proves de PCR comercials tenen múltiples objectius on detecten el virus, de manera que fins i tot si una mutació afecta un dels objectius, els altres objectius de PCR encara funcionaran.

De fet, la infecció provocada per la nova soca al Regne Unit també es va detectar mitjançant la prova RT-PCR convencional.

Els laboratoris que utilitzen assajos de PCR interns que es dirigeixen al gen S del virus també haurien de ser conscients d'aquest problema potencial. Per tal de limitar l'impacte en les capacitats de detecció dels països, també es recomana un enfocament que utilitzi diferents assajos en assajos paral·lels o múltiplex dirigits a diferents gens virals per permetre la detecció de possibles variants sorgides, segons havia recomanat l'OMS.

No et perdis Explained| Per què el coronavirus a l'Antàrtida encara no és una preocupació índia

Afectarà el desenvolupament de vacunes?

El CDC ha dit que les vacunes aprovades per la Food and Drug Administration (FDA) dels Estats Units són policlonals i produeixen anticossos que s'adrecen a diverses parts de la proteïna espiga.

El virus probablement hauria d'acumular múltiples mutacions a la proteïna espiga per evadir la immunitat induïda per vacunes o per infecció natural, ha dit.

I l'OMS ha dit: Els estudis de laboratori estan en curs per determinar si aquests virus variants tenen propietats biològiques diferents o alteren l'eficàcia de la vacuna. Actualment no hi ha prou informació per determinar si aquesta variant s'associa amb algun canvi en la gravetat de la malaltia clínica, la resposta d'anticossos o l'eficàcia de la vacuna.


quant val Deitrick Haddon