Explicació: variant B.1.617 i augment del Covid-19 a l'Índia
Les dades de seqüenciació del genoma han presentat proves del 'doble mutant' en el 61% de les mostres a Maharashtra. Però si aquesta nova variant està impulsant l'augment continu de l'Índia només es pot dir després que hi hagi més dades disponibles.
Els treballadors sanitaris preparen llits al Shehnai Banquet Hall de Nova Delhi, que s'ha convertit en una sala temporal per a pacients amb Covid-9. (Foto exprés: Amit Mehra) Durant una reunió amb laboratoris de districte a Maharashtra la setmana passada, l'Institut Nacional de Virologia (NIV) va compartir dades limitades que mostraven una ruptura de 361 mostres seqüenciades del genoma recollides entre gener i març d'aquest any.
La troballa del titular de l'anàlisi : es va detectar la presència d'una doble mutació en 220 —gairebé el 61 per cent— de les mostres. Aquesta variant doble es va classificar la setmana passada com a variant B.1.617.
Butlletí informatiu| Feu clic per rebre els millors explicadors del dia a la vostra safata d'entrada
Què és el B.1.617?
La variant B.1.617 del SARS-CoV-2 porta dues mutacions, E484Q i L452R. Tots dos es troben per separat en moltes altres variants de coronavirus, però s'han informat junts per primera vegada a l'Índia.
Les dues mutacions es troben a la proteïna espiga del virus. La proteïna espiga ajuda al virus a unir-se als receptors de la cèl·lula humana i a entrar a la cèl·lula hoste.
La mutació E484Q és similar a l'E484K, una mutació que es troba a les variants del coronavirus del Regne Unit (linatge B.1.1.7) i Sud-àfrica (B.1.351).
La mutació L452R s'ha trobat en variants de ràpida propagació a Califòrnia (B.1.427 i B.1.429). Pot augmentar el poder d'unió de les proteïnes de punta amb els receptors ACE2 a les cèl·lules humanes, fent-lo més transmissible. L452R també pot millorar potencialment la replicació viral.
Junts, E484Q i L452R són més infecciosos i poden evadir els anticossos.
On s'ha trobat el B.1.617?
Hi ha dades limitades. Es va informar per primera vegada des de Maharashtra. Al gener es van seqüenciar 19 mostres de diversos districtes i es va trobar B.1.617 en quatre. Al febrer, es van seqüenciar 234 mostres de 18 districtes i 151 mostres, d'almenys 16 districtes, tenien aquesta variant. I al març, fins a 65 de 94 mostres en tenien.
Fins ara, els districtes d'Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad i Chandrapur han presentat una forta evidència de la presència de B.1.617. Es van seqüenciar menys mostres en altres districtes i la variant es va trobar en alguns. La seqüenciació està pendent per a més mostres.
UNIR-SE ARA :L'Express Explained Telegram Channel
Aquesta variant és més virulenta?
No hi ha proves fins ara. La majoria dels pacients poden fer-ho amb l'aïllament domiciliari, tot i que l'experiència clínica s'ha de combinar amb dades de seqüenciació del genoma per generar evidència científica. Les anècdotes clíniques dels metges suggereixen que la variant s'estén més ràpidament, és més infecciosa, pot infectar famílies senceres, però és menys virulenta i no provoca dramàticament més hospitalitzacions.
La majoria dels pacients són asimptomàtics i això és una bona indicació. Però, en nombres absoluts, tants casos han suposat una càrrega per a la infraestructura sanitària, va dir el doctor Shashank Joshi, expert en el grup de treball Covid de Maharashtra.
Quant s'ha estès?
El doctor Sujeet Singh, director del Centre Nacional per al Control de Malalties (NCDC) ha assenyalat que fins ara s'han seqüenciat molt poques mostres de Maharashtra i és massa aviat per extreure conclusions definitives sobre la difusió del doble mutant. Tanmateix, el govern central havia informat al març que entre el 15 i el 20% de les mostres a Maharashtra tenien aquesta variant; sobre la base de les últimes dades de seqüenciació sabem que aquesta xifra supera ara el 60 per cent.
Els metges i els administradors del districte de Maharashtra informen que, a diferència de la primera onada, famílies senceres s'infecten a la segona onada. Això podria indicar que les mesures de distanciament físic i aïllament són inadequades a la llar o que el virus s'ha tornat més transmissible.
jules asner 2017
Podria B.1.617 estar impulsant l'augment continu dels casos de Covid-19?
El doctor Gangandeep Kang, professor de microbiologia al Christian Medical College de Vellore, va dir que el 60,9% de les mostres que portaven aquesta variant probablement mostraven un vincle entre la mutació i l'augment, però, per obtenir una resposta precisa, almenys l'1% de les mostres de Covid-19 s'han de seqüenciar cada setmana. Amb l'Índia actualment provant més d'1 mil casos diaris, i això es traduiria en aproximadament 1.000 seqüències del genoma cada dia.
També hem de mirar quantes persones pot infectar una persona i el llindar del cicle RT-PCR. Hem de fer un seguiment en directe. Les dades del gener tenen poc valor a l'abril, va dir el doctor Kang.
Gautam Menon, professor de la Universitat d'Ashoka, Sonepat, i de l'Institut de Ciències Matemàtiques de Chennai, va dir: El que tenim és suggerent, però necessitem més dades de seqüenciació del genoma per entendre quina variant està impulsant el nombre de noves infeccions en diferents estats... Per suggerir que l'augment dels casos es deu a aquesta variant de doble mutant, hauríem de tenir més punts de temps. Per exemple, si poguéssim dir que vam detectar el 30 per cent d'aquesta variant en mostres el 30 de març, i després el 40 per cent en mostres el 14 d'abril, això indicaria que la nova variant domina la propagació de la malaltia.
El doctor Menon també va subratllar la necessitat d'una major transparència de les dades. És possible, encara que cada cop més improbable, que els casos també es puguin connectar a la soca anterior, va dir. A menys que sabem fins a quin punt l'augment es pot atribuir a la nova variant, no podrem determinar de manera concloent si les relaxacions del comportament adequat per a la Covid amb la soca més antiga van impulsar els augments o si l'augment de la infectivitat de la nova variant és responsable.
El professor Vinod Scaria, científic principal, CSIR -IGIB, va coincidir que no podem dir de manera concloent que aquestes variants estan impulsant l'augment de la segona onada. Tanmateix, l'evidència suggereix que almenys en alguns estats, el llinatge B.1.1617 és predominant i podria estar contribuint a l'augment dels casos, va dir. Aquest llinatge es defineix per 15 variants genètiques que inclouen sis variants de proteïna espiga. Dos d'aquests (E484Q i L452R) estan implicats en la fugida immune i en l'augment de la infecciositat, va dir el professor Scaria.
Pot la variant eludir les vacunes?
De nou, les dades són limitades. De fet, algunes persones s'han infectat després de la primera dosi, però no hi ha dades sobre si les seves mostres es van enviar per a la seqüenciació del genoma.
Sabem que la variant sud-africana és més capaç d'escapar de la resposta immune. Sabem que la variant del Regne Unit és la més transmissible. Però no sabem res sobre B.1.617 fins ara, perquè no estem reunint dades per treure conclusions, va dir el doctor Kang.
El doctor Menon va subratllar que, tot i que no s'espera que les vacunes previnguin la infecció, sens dubte eviten malalties greus i morts. Esperem que això segueixi sent cert fins i tot amb la nova variant. L'única solució a mitjà i llarg termini per fer front al Covid-19 és que la gent es vacuni.
Comparteix Amb Els Teus Amics:
